Amigo, de verdade.... no final do seu texto você diz que tem medo de como ele vai te ver, medo da reação dele, medo dele querer terminar e etc, mas eu acho que quem tem motivos pra terminar é você. Na realidade, eu não acho nem que ele tá namorando com você, você tá namorando sozinho.
Não acho que você tá tendo paranoias, acho que acabou descobrindo a realidade do que tá acontecendo. Ao que parece, esse cara não enxerga o relacionamento de vocês como algo real, como um relacionamento de verdade. Ele tem uma vida dupla, separando a vida online da vida real, e você existe pra ele só na vida online. Os amigos dele não sabem de você, você não tá incluído no ciclo de pessoas que realmente convivem com ele, e ele aparentemente tá tendo um rolo com uma menina desse grupo. Muito possivelmente ele pediu um tempo da relação de vocês e está afastando simplesmente porque ele não está mais a fim de continuar esse teatrinho que ele faz com você, e é mais fácil te dizer isso do que falar a verdade do que está acontecendo.
Mesmo que ele tenha feito tudo isso porque vive em conflito com a sexualidade dele, ainda não é aceitável.
Eu de verdade acho é que você está sendo muito passivo diante de todas essas descobertas.
Não sei a sua idade mas você parece ser bem novinho. Eu também já comecei relacionamentos online quando eu era adolescente, mas anos depois eu aprendi o seguinte: por mais que a gente tenha sentimentos super fortes por aquela pessoa, por mais que a gente sinta que conhece ela muito bem, muito provavelmente isso não é verdade. Tendo contato só online é muito fácil esconder coisas dos outros, é fácil viver uma vida dupla, mentir sobre o que a gente faz e sobre quem a gente é. Hoje em dia, eu sinceramente não cogitaria entrar em uma relação onde eu nunca cheguei a conhecer a pessoa na vida real, e onde a gente não faça parte da vida real um do outro, mesmo que passando períodos geograficamente afastados.
Geralmente eu aconselho as pessoas a conversarem com os seus parceiros e tudo mais, mas no seu caso, eu acho que conversar com o seu namorado vai servir só pra ele continuar mentindo pra você, e te enrolando. Posso estar errada te dizendo isso, mas se ele teve todo esse trabalho de esconder de você toda a vida dele, de separar os amigos online e presenciais dele dessa forma onde essas duas realidades são tão completamente separadas, eu duvido muito que ele dê o braço a torcer e tenha uma conversa honesta com você.
No seu lugar, eu me afastaria dessa pessoa, terminaria o relacionamento por mim, e procuraria me envolver mais com as pessoas que eu tenho na vida real.
Relacionamentos à distancia são complicados, os que são exclusivamente online são mais complicados ainda, e viver tudo isso sendo jovem e não tendo experiencia só dificulta mais as coisas. Tenta se afastar disso por um tempo.
Espero não ter falado besteira. Eu imagino o quanto você deve estar confuso e se sentindo mal com essas descobertas, mas daqui um tempo essas coisas vão passar. Boa sorte, e que tudo corra da melhor maneira possível pra você.